Formation qualifiante : Initiation à la programmation informatique pour biologistes - Module 2 : introduction à la programmation PERL

Commencer à utiliser un outil de programmation : 1) développer ses propres programmes ; 2) pouvoir lire les programmes déjà développés par d’autres (des développeurs confirmés) et les adapter à sa propre utilisation.

PARIS

Contenu

Partie théorique 4h par jour

• Pourquoi utiliser PERL
• Types de données
• Structures de contrôles
• Gestion de fichiers
• Expressions régulières
• Programmation objet : PERL/Tk
• Quelques pistes pour utiliser bioPERL
Partie pratique 4h par jour
- Les deux premières journées seront consacrées à mettre en application les principes de base de la programmation par des exercices spécifiques. Les exemples donnés sont toujours en lien avec des problématiques biologiques, gestion de séquences d’ADN, de protéines, séquences multiples.
- La dernière journée sera entièrement consacrée à la programmation objet, pour pouvoir mettre en place une interface graphique simple et pouvoir aborder les librairies bioPERL, outil contenant plus de 1000 paquets, permettant de résoudre des problématiques biologiques.

Objectifs

Etre familiarisé-e à l’utilisation d’un outil de programmation
Savoir développer ses propres programmes
Pouvoir lire les programmes déjà développés par d’autres (des développeurs
confirmés) et les adapter à sa propre utilisation

Prérequis

N.C

Diplôme visé

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PARIS 1350 4 jour(s)
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